Imagerie 3D et Morphométrie

Pour contacter le personnel de :
Biogéosciences : prenom.nom@u-bourgogne.fr
 Chrono-environnement : prenom.nom@univ-fcomte.fr

Cette unité de Biogéosciences étudie la variabilité inter et intra-spécifique spatio-temporelle des caractères morphométriques ainsi que la mise en place des innovations morphologiques dans différents groupes (rongeurs, primates, céphalopodes…) en utilisant des outils statistiques et morphométriques.

  • Morphométrie géométrique

Contact Biogéosciences : sebastien.couette ; nicolas.navarro ; lauriane.poloni

  • Stockage et gestion des métadonnées d’imagerie

    Baie de stockage Dell Precision T7600 24 To

Contact Biogéosciences : remi.laffont

  • Acquisition : scanner surfacique

    Scanner surfacique Flexscan 3D à lumière structurée équipé d’une table tournante micropas
    Einscan pro équipé d’une table tournante
    Station de photogrammétrie
    Micro CT scanner
    Micro-tomographie par rayons X assisté par ordinateur : scanner SkyScan 1174 (Bruker)
    Landmarks 3D : digitaliseur 3D MicroScribe G2X Landmarks 3D Micro CT scanner

  • Traitement

    Station d’analyse d’image – Dell Precision T7610 : 64GB RAM, double carte graphique Quadro K5000, 2*8 cœurs équipée d’une tablette graphique (WACOM Cintiq) et des logiciels ImageJ, Meshlab, R, Avizo
    Station de calcul – Dell Precision T7600 : 2 GPGPU Tesla K20c, 16 cœurs dédiée à la segmentation automatique (via les bibliothèques ANTs et ANTsR) et manuelle, ainsi qu’au traitement de photogrammétrie (PhotoScan)

Contact Biogéosciences : emilie.steimetz ; remi.laffont

  • Imprimante 3D MakerBot Replicator 2

Contact Biogéosciences : remi.laffont