Plateau technique d’analyse comportementale vidéo à Biogéosciences

Plateau technique d’analyse comportementale vidéo à Biogéosciences

6 septembre 2011 Par admin2995
Système vidéo tracking Statif
Système vidéo tracking GamBox

Les systèmes d’analyse vidéo ViewPoint® présents à Biogéosciences depuis 2011, projets soutenus par le DIPEE de Bourgogne Franche-Comté, sont utilisés pour réaliser des suivis comportementaux d’animaux de petite taille (millimétrique à centimétrique ; en particulier les gammares) sur une durée déterminée. Alexandre Bauer, ingénieur en écologie au laboratoire Biogéosciences, nous explique en quelques mots comment sont utilisés ces instruments.

Alexandre Bauer : « Le premier système de vidéo tracking que l’on appelle Statif, dispose d’un plateau infra-rouge permettant d’accueillir 16 boîtes de pétri dans lesquelles sont placés les individus. Couplé à la caméra infra-rouge fixée au-dessus et réglable en hauteur, on peut suivre le comportement de plusieurs individus sur une durée paramétrable. Les mesures prises pendant le temps de l’expérience nous renseignent sur l’activité ou l’inactivité de chaque individu, la trajectoire et la vitesse de leur déplacement ou encore les distances parcourues. Le second système de vidéo tracking, appelé GamBox, est une armoire dans laquelle on peut contrôler l’éclairage à volonté. Il est donc possible de simuler un lever ou un coucher de soleil, un nuage qui passe, ou bien un noir total interrompu par exemple par un orage grâce à l’utilisation des flashs ! »

L’utilisation de ces équipements présents au laboratoire, a fait l’objet de plusieurs publications scientifiques, notamment dans les revues Proceeding the Royal Society Biological Sciences ou encore International Journal for Parasitology dont deux extraits vous sont présentés ci-dessous.

Perrot-Minnot M-J, Sanchez-Thirion K, Cézilly F. Multidimensionality in host manipulation mimicked by serotonin injection. Proc. R. Soc. B 281 (2014) 19-15

“ After an acclimatization time of 5 min, the time spent moving above a speed threshold of 15 mm s21 was video-recorded during 5 min using the Lighting Infrared system and an infrared camera connected to a laptop (Zebralab software, View Point, Lyon, France). Preliminary tests showed that below 15 mm s21, moving gammarids tend to crawl rather than swim. Activity was therefore scored as the proportion of time spent swimming.”

Dianne L, Perrot-Minnot M-J, Bauer A, Guvenatam A, Rigaud T. Parasite-induced alteration of plastic response to predation threat: increased refuge use but lower food intake in Gammarus pulex infected with the acanothocephalan Pomphorhynchus laevis. International Journal for Parasitology 44 (2014) 211–216

“ The activity of infected and control gammarids was recorded and analysed using a ViewPoint device and software (© Viewpoint Life Sciences, Inc. – 2010, France). Gammarids were placed individually in Petri dishes (diameter 8.5 cm, height 1 cm) filled with either control water or scented water. After 2 min of acclimatisation, gammarid activity was recorded with an infrared camera for 5 min (continuous recording), as the proportion of time spent swimming (movements at a speed above 15 mm s-1) and distance covered. This speed threshold was determined based on preliminary tests, showing that below 15 mm s-1 discrimination is not always  possible  between  gammarids  moving  at  low  speed (crawling) and inactive gammarids (still moving their pleopods for respiration).”