Pour contacter le personnel de :
Biogéosciences : prenom.nom@u-bourgogne.fr
Chrono-environnement : prenom.nom@univ-fcomte.fr
PCR classique
Détermination du sexe moléculaire – Détection et identification de divers parasites – PCR pour analyses de polymoprohisme génétiques de marqueurs microsatellites, de l’ITS de l’ADN ribosomal, de marqueurs mitochondriaux
Thermo-cycleurs 3 blocs 48 puits BIOMETRA, Thermo-cycleurs Dyad 2 blocs 96 puits BIORAD, Thermo-cycleur Disciple 2 blocs 96 puits BIORAD, 5 Thermo-cycleurs C1000 touch BIORAD bloc 96 puits, Thermo-cycleurs S1000 touch BIORAD bloc 96 puits, système d’imagerie pour applications moléculaires elDoc XR Biorad3 Thermo-cycleurs – C1000 Touch Thermal cycler BIORAD ; Veriti 96 wells Thermal cycler APPLIED ; T300 Thermo-cycler BIOMETRA, système d’imagerie ChemiDoc™ MP Imaging System (BIORAD) ; 2 thermocycleurs Mastercycler nexus EPPENDORF ; SimpliAmp Thermal cycler APPLIED BIOSYSTEMS ; QIAxcel Advanced System QIAGEN
PCR en temps réel
Détection et quantification de parasites sanguins – Quantification de l’expression de gènes par RT-qPCR – Quantification d’ADN par picogreen – Quantification d’ADN de micro-organismes dans l’environnement – Echinococcus dans les crottes de renard
Hotte UV PCR, PCR en temps réel STEP ONE PLUS APPLIED BIOSYSTEMS
Appareil de dépôt QIAgility (QIAGEN), lecteur de plaques qPCR temps réel – Applied 7500 Fast Real time PCR System (APPLIED) x2, lecteur de tubes qPCR – Rotor-Gene Q (QIAGEN)
Contacts Biogéosciences : maria.teixeira ; stephane.garnier ; aurelie.khimoun ; remi.wattier
Contact Chrono-environnement – Haut de Chazal : audrey.laboissiere
Contact Chrono-environnement – Montbéliard : michel.chalot
Contacts Chrono-environnement – La Bouloie : romain.borne ; anne-claude.goydadin
- Biophotometer (EPPENDORF), Nanophotomètre (IMPLEN), Fluorophotomètre Qubit2.0 (INVITROGEN), Nanovue plus spectrophotometer (BIOCHROM), Quantus fluorometer (PROMEGA)
Contact Chrono-environnement – Haut de Chazal : audrey.laboissiere
Contact Chrono-environnement – Montbéliard : michel.chalot
Contacts Chrono-environnement – La Bouloie : romain.borne ; anne-claude.goydadin
Analyse de séquence haut débit
Épidémiologie de micro-organismes pathogène – métagénomique (bactérie et champignons du sol, microbiote intestinal, régime alimentaire)
Serveur de calcul Galaxy
Assemblages de séquences RADseq
Pipeline Stacks
Contact Biogéosciences : aurelie.khimoun
Contact Chrono-environnement : benoit.valot
Analyse et comparaison de génomes microbiens
Contact Chrono-environnement : didier.hocquet