Biologie moléculaire – Génétique/Génomique

Pour contacter le personnel de :
Biogéosciences : prenom.nom@u-bourgogne.fr
Chrono-environnement : prenom.nom@univ-fcomte.fr
  • PCR classique

    Détermination du sexe moléculaire – Détection et identification de divers parasites – PCR pour analyses de polymoprohisme génétiques de marqueurs microsatellites, de l’ITS de l’ADN ribosomal, de marqueurs mitochondriaux
    Thermo-cycleurs 3 blocs 48 puits BIOMETRA, Thermo-cycleurs Dyad 2 blocs 96 puits BIORAD, Thermo-cycleur Disciple 2 blocs 96 puits BIORAD, 5 Thermo-cycleurs C1000 touch BIORAD bloc 96 puits, Thermo-cycleurs S1000 touch BIORAD bloc 96 puits, système d’imagerie pour applications moléculaires elDoc XR Biorad

    3 Thermo-cycleurs – C1000 Touch Thermal cycler BIORAD ; Veriti 96 wells Thermal cycler APPLIED ; T300 Thermo-cycler BIOMETRA, système d’imagerie ChemiDoc™ MP Imaging System (BIORAD) ; 2 thermocycleurs Mastercycler nexus EPPENDORF ; SimpliAmp Thermal cycler APPLIED BIOSYSTEMS ; QIAxcel Advanced System QIAGEN

  • PCR en temps réel

    Détection et quantification de parasites sanguins – Quantification de l’expression de gènes par RT-qPCR – Quantification d’ADN par picogreen – Quantification d’ADN de micro-organismes dans l’environnement – Echinococcus dans les crottes de renard
    Hotte UV PCR, PCR en temps réel STEP ONE PLUS APPLIED BIOSYSTEMS
    Appareil de dépôt QIAgility (QIAGEN), lecteur de plaques qPCR temps réel – Applied 7500 Fast Real time PCR System (APPLIED) x2, lecteur de tubes qPCR – Rotor-Gene Q (QIAGEN)

Contacts Biogéosciences : maria.teixeira ; stephane.garnier ; aurelie.khimoun ; remi.wattier
Contact Chrono-environnement – Haut de Chazal : audrey.laboissiere
Contact Chrono-environnement – Montbéliard : michel.chalot
Contacts Chrono-environnement – La Bouloie : romain.borne ; anne-claude.goydadin

  • Biophotometer (EPPENDORF), Nanophotomètre (IMPLEN), Fluorophotomètre Qubit2.0 (INVITROGEN), Nanovue plus spectrophotometer (BIOCHROM), Quantus fluorometer (PROMEGA)

Contact Chrono-environnement – Haut de Chazal : audrey.laboissiere
Contact Chrono-environnement – Montbéliard : michel.chalot
Contacts Chrono-environnement – La Bouloie : romain.borne ; anne-claude.goydadin

  • Analyse de séquence haut débit


    Épidémiologie de micro-organismes pathogène – métagénomique (bactérie et champignons du sol, microbiote intestinal, régime alimentaire)

    Serveur de calcul Galaxy


    Assemblages de séquences RADseq

    Pipeline Stacks

Contact Biogéosciences : aurelie.khimoun
Contact Chrono-environnement : benoit.valot

  • Analyse et comparaison de génomes microbiens

    Contact Chrono-environnement : didier.hocquet